J'utilise sur mon portable un système de fichier crypté pour la partition /home. C'est une solution que j'ai mise en place il y a plusieurs année, et j'ai donc utilisé cryptoloop, maintenant mon choix se porterait vers dm-crypt. Ce n'est pas lié à un fs particulier (j'utilise ext3, mais n'importe quel fs marchera)

Je ne connais pas truecrypt, mais pour EncFS, c'est surtout pratique si tu ne veux pas crypter l'ensemble des fichiers d'une partition. L'inconvénient que je lui ai trouvé, c'est que la structure des dossiers est visible (et toutes les infos associées aux inodes). Avec cryptoloop/dm-crypt, c'est toute la partition qui est cryptée...