VTK : la visualisation scientifique et au delà !

Posté par  (site web personnel) . Édité par Ysabeau 🧶 🧦, Benoît Sibaud, Pierre Jarillon et palm123. Modéré par Ysabeau 🧶 🧦. Licence CC By‑SA.
121
4
fév.
2021
Science

VTK est une bibliothèque libre incontournable de la visualisation scientifique, pourtant peu citée sur LinuxFr. Rattrapons le retard !

Logo de VTK

VTK est en quelque sorte le couteau suisse de la visualisation scientifique. La suite de cet article vous donnera un aperçu de ses domaines d’utilisation en s’appuyant sur de nombreux exemples abondamment illustrés.

Journal Combien valent les exoplanètes ?

95
23
fév.
2011

Depuis 1995 l'humanité est véritablement entrée dans une nouvelle ère. Alors que, depuis l'aube des temps, nous ne savions pas si d'autres planètes existaient autour des étoiles lointaines, voilà que soudain la première d'entre elle était découverte en orbite autour de 51 Pegasi.

Après 2 500 ans de spéculations nous avions enfin une réponse ! Six siècles après la condamnation à mort de Giordano Bruno nous savions enfin qu'il avait eu raison ! Les exoplanètes existent bel et bien (…)

Journal De l'utilité de formater plusieurs fois son disque dur

Posté par  .
Étiquettes :
90
27
mai
2009
L'histoire d'une controverse intéressante quoique pas assez connue...

Comme la plupart des informaticiens j'ai toujours considéré comme acquis le fait de savoir que l'on puisse récupérer les données d'un disque dur même si celles-ci ont été complètement écrasées de multiple fois. Cela motive d'ailleurs la procédure qui consiste lors d'un formatage de bas niveau, à effectuer de multiple cycles d'écriture, si possible avec des données aléatoires, comme le fait l'utilitaire DBAN.

J'avais même entendu à l'époque qu'il était possible de (…)

Journal VGER near to be out, stay tuned

Posté par  (site web personnel) . Licence CC By‑SA.
71
23
mar.
2012

Un petit journal à propos de V`GER. Parce que, ça y est, Voyager 1 est à 18 milliards de kilomètres de chez nous (soit ~6.7UA, soit ~0.0001AL). C'est la première fois qu'une réalisation humaine atteint cette frontière. Résumé des évènements :

  • lancement le 5 septembre 1977
  • 1979, passe aux alentours de Jupiter, et nous dévoile cette tumultueuse, et les volcans d'une de ses lunes, Io.
  • 1980, elle s'approche de Saturne, on lui fait faire quelques pas de danse imprévus (…)

L'astronomie libre sous Linux : le point fin 2012, début 2013

Posté par  (site web personnel) . Édité par baud123, Benoît Sibaud et Nÿco. Modéré par patrick_g. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
68
2
jan.
2013
Science

L'astronomie est un passe-temps vraiment sympathique qui permet de relativiser pas mal et de réfléchir sur notre place dans l'univers. Elle contient un côté poétique intéressant et pourtant, quand on veut commencer à se faire plaisir en prenant des photos d'objets aux dimensions difficilement compréhensibles, on peut se fait peur avec la pauvre logithèque linuxienne. Ceci est la première impression, fausse et c'est l'heure de faire un point et de motiver les utilisateurs.

L'hiver est la saison préférée des astronomes amateurs : si on plie à 22h, on a eu 4 h de nuit. Les nuits de janvier et février sont souvent très claires car très froides !

Un peu de lune, chaîne d'acquisition et traitement 100% Linux

Recalage d’images, PIV et corrélation d’images — Les bases théoriques

Posté par  . Édité par ZeroHeure, Davy Defaud, Benoît Sibaud, NeoX et palm123. Modéré par ZeroHeure. Licence CC By‑SA.
62
4
juil.
2017
Science

Le recalage d’images est utilisé dans la communauté de l’analyse d’images médicales depuis très longtemps (Barnea & Silverman, 1972, Ledbetter et al. 1979), on peut même remonter plus loin dans le temps avec les travaux de Sidney Bertram, 1963 en fournissant tous les outils via des descriptions de circuits analogiques (vraiment impressionnant pour l’époque).
En commençant à travailler sur des images issues d’IRM, j’ai été amené à faire une bibliographie sur les outils utilisés dans l’analyse d’images médicales. J’ai constaté que leurs techniques de recalage d’images étaient très similaires à celles utilisées dans les différents domaines de la mécanique. Après beaucoup de bibliographie, je suis parvenu à situer ce qui est fait en mécanique dans les cadres proposés en analyse d’images médicales.

Cette dépêche est l’occasion pour moi de présenter ces techniques dans le détail.


La prochaine dépêche présentera les logiciels utilisés dans les différentes communautés scientifiques.

Comment les idées du mouvement Open-source peuvent aider à étudier les exoplanètes

60
28
nov.
2013
Science

Hanno Rein est un spécialiste des exoplanètes qui occupe un poste de professeur assistant en astrophysique à l'université de Toronto. Entre 2010 et 2013 il a effectué son post-doctorat à l'Institute for Advanced Study de Princeton et, à cette occasion, il a écrit plusieurs petits articles de vulgarisation sur les exoplanètes.

L'un de ces articles publié par l'IAS s'intitule "How Open-Source Ideas Can Help Us Study Exoplanets" et il m'a semblé qu'il justifiait une traduction pour les lecteurs de LinuxFr.org.

Hanno, après avoir été contacté par courriel, a eu la gentillesse de m'autoriser à publier son article sur le site en le plaçant sous licence CC-BY-SA. Merci à lui.

Plus de détails dans la suite de la dépêche.

MathMod 4.0 : nouveaux outils de manipulation des objets mathématiques

Posté par  (site web personnel) . Édité par Davy Defaud, Benoît Sibaud, Nÿco et claudex. Modéré par Pierre Jarillon. Licence CC By‑SA.
54
11
fév.
2016
Éducation

MathMod (anciennement K3DSurf) est un logiciel libre (sous licence GPL v3) de modélisation et de manipulation des objets mathématiques décrits par des équations implicites ou paramétriques. MathMod permet de manipuler les objets mathématiques 3D et 4D en les animant d’un mouvement de rotation ou de déformation. Il permet aussi de changer leur propriétés visuelles, calculer leurs intersections en temps réel et exporter le résultat final sous différents formats de fichiers. MathMod est développé avec Qt5/C++, il est disponible pour GNU/Linux, Windows et Mac OS X.

MathModd-4.0

Du droit de bidouiller : un test génétique fait fi des brevets sur les gènes

Posté par  (site web personnel) . Modéré par Xavier Teyssier.
53
15
oct.
2010
Science
Tout le monde en parle : dans un article publié il y a quelques jours dans la revue Genome BIology, deux chercheurs de l'Université du Maryland ont créé un programme pouvant identifier 68 mutations associées avec une susceptibilité accrue aux cancers du sein et des ovaires. Jusqu'ici, rien de spectaculaire : il y a un tas de geeks qui écrivent des programmes extras. Celui-ci est tout de même un peu spécial : comme je l'avais relaté il y a quelques mois, la bataille juridique autour des brevets accordés à l'entreprise Myriad Genetics pour la possession et exploitation exclusive des séquences des gènes incriminés fait rage. Voilà que ce programme (libre) présente un do-it-yourself (« faites-le-vous-mêmes ») test génétique et ce, sans avoir peur de brevets.

Sortie de MathMod 9.1

Posté par  (site web personnel) . Édité par bubar🦥, ZeroHeure et Davy Defaud. Modéré par claudex. Licence CC By‑SA.
53
2
mai
2019
Administration système

Je suis heureux d’annoncer la publication de la nouvelle version (9.1) de MathMod. MathMod est un logiciel libre de modélisation et de manipulation des objets mathématiques décrits par des équations implicites ou paramétriques. MathMod permet de manipuler les objets mathématiques 3D et 4D. Il permet aussi de changer leur propriétés visuelles (appliquer des textures 3D, une transparence…), calculer leurs intersections en temps réel et exporter le résultat final sous le format de fichier OBJ. MathMod est développé en C++ avec Qt5, il est disponible pour GNU/Linux, Windows et macOS, sous licence GPL v3.

Aussi, MathMod peut être configuré pour exploiter au mieux les ressources matérielles : répartition du calcul sur plusieurs cœurs, accélération graphique OpenGL, allocation de mémoire…

Titre de l’image

Journal Une dernière chance pour le magazine scientifique papier

Posté par  . Licence CC By‑SA.
49
10
mai
2021

J'hésitais à ne déclarer qu'un lien, mais finalement je pense qu'il y a de quoi écrire un journal.

On voit petit à petit les magazines mourir, transformés en sites internet mêlant contenu éditorial et commercial, avec des articles non sourcés écrits par des prestataires de services sans journalistes. Le destin de France soir, devenu un blog putassier prêt à raconter n'importe quoi pour attirer du clic, menace beaucoup de titres aujourd'hui.

L'année dernière, le magazine Science & vie a commencé (…)

Journal [HS] PAMELA et l'éthique scientifique

Posté par  (site web personnel) .
48
3
sept.
2008
Sur le Net les blogs scientifiques spécialisés en cosmologie bruissent de rumeurs au sujet des résultats du satellite PAMELA (projet russo-italien qui consiste a analyser en orbite la composition des rayons cosmiques afin d'aider à résoudre le mystère de la matière noire) et j'ai pensé que c'était une bonne occasion de parler de toutes ces questions passionnantes.

En gros depuis les années 30 l'astronomie est confrontée à un gros problème. Quand on examine la vitesse des galaxies dans un (…)

Journal Rumeurs de Higgs

Posté par  (site web personnel) . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
48
22
avr.
2011

Deux ans après le précédent journal LinuxFR qui faisait le point sur la chasse au boson de Higgs ou en est la recherche ? Quelles sont les dernières rumeurs du monde de la physique des particules....et surtout qui va gagner la course entre le LHC européen et le Tevatron américain pour trouver cette particule cruciale ?

Tout d'abord il est à noter que le Tevatron semble distancé dans cette compétition. Les problèmes budgétaires de l'état fédéral américain ont conduit à (…)

Journal Einstein avait finalement raison! (comme toujours)

Posté par  (site web personnel) . Licence CC By‑SA.
48
17
oct.
2011

Journal presque bookmark pour vous rassurer sur l'événement qui a fait frétiller tous les scientifiques du monde il y a quelques semaines: des neutrinos plus rapides que la lumière auraient été détectés par les scientifiques du CERN.

Tankey en avait fait un journal, et aujourd'hui, au détour d'internet, j'ai trouvé cet article qui explique les raisons de la tromperie (malencontreuse):
http://www.fellowgeek.com/a-Einstein%E2%80%99s-Theory-Still-Safe.html

Et l'article original:
http://dvice.com/archives/2011/10/speedy-neutrino.php

Pour résumer: les scientifiques se sont servis des signaux GPS pour déterminer, à 20 (…)

Journal L'open source, un gage de reproductibilité en science

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
47
26
fév.
2012

Un article publié dans la revue Nature par des chercheurs britanniques explique pourquoi les programmes écrits par les scientifiques pour obtenir leurs résultats devraient toujours être open source et facilement accessibles. Comme l'article est long, je vais en faire un résumé.

Les physiciens, biologistes et autres climatologues écrivent couramment des programmes informatiques pour traiter et analyser automatiquement leurs données ou calculer les prédictions de leurs modèles théoriques. Dans le domaine de la biologie, je ferais remonter ça au moins à (…)