Journal Sortie de matplotlib 2.0

Posté par . Licence CC by-sa
54
18
jan.
2017

Bonjour à toutes les moules scientifiques (et les autres !),
la bibliothèque python Matplotlib vient de sortir en version 2.

Pour info, matplotlib est la bibliothèque de référence pour le tracé de données avec python. Elle permet de tracer des graphs de grande qualité que ce soit en 2D ou 3D (cf la galerie du site). Pour les aficionados des logiciels privateurs à plusieurs milliers d'euros (commençant par mat et terminant par lab), il est possible d'utiliser le namespace pyplot qui (...)

Kst, outil de tracés graphiques convivial et puissant

Posté par . Édité par Davy Defaud, Nils Ratusznik, ZeroHeure et Benoît Sibaud. Modéré par ZeroHeure. Licence CC by-sa
44
19
nov.
2014
Science

Kst est un outil de tracés graphiques et d’analyse de données très rapide et convivial, libre (Qt) et multi‐plate‐forme : Windows, Mac OS X et GNU/Linux. Kst est comparable à LabPlot, Veusz, QtiPlot ou encore SciDAVis.

La version 1, plus maintenue à l’heure actuelle, était une application KDE à laquelle ont contribué des grands noms du projet KDE comme George Staikos, gage d’une bonne qualité de code. Lors du portage en Qt4, les dépendances aux bibliothèques KDE ont été supprimées pour faciliter la distribution sur toutes les plates‐formes.

Des versions de Kst2 stables et pleinement fonctionnelles sont disponibles depuis assez longtemps, mais cet outil reste malheureusement trop peu connu. Pour remédier à cela, des tutoriels vidéo ont été préparés en utilisant la version 2.0.8 sortie en juillet dernier. Ces tutoriels sont disponibles sur la chaîne Kst plot sur YouTube, pour vous faire (re)découvrir les principales fonctionnalités de cet outil.

N. D. M. : l’auteur de la dépêche est l’un des développeurs de Kst, profitez‐en si vous avez des questions !

Tulip disponible en version 3.5.0

Posté par . Modéré par Lucas Bonnet. Licence CC by-sa
36
5
avr.
2011
Science

Tulip, le logiciel de visualisation et d’édition de graphes développé par une équipe du LaBRI (Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique), est disponible en version 3.5.0.

Cette version apporte des nouveautés importantes, des améliorations de l’interface graphique et corrige un certain nombre de bogues.

La suite de cette annonce est une traduction de l’annonce officielle.

NdM : Tulip est sous licence LGPL.

GeoBases version 5, services et visualisation pour données (géographiques)

Posté par . Modéré par Xavier Claude. Licence CC by-sa
32
15
mar.
2013
Technologie

GeoBases version 5 vient d’être publié! Il y a six semaines ce projet passait open-source. Depuis, grâce à de nombreux retours, nous avons pu améliorer, documenter, corriger de nombreuses fonctionnalités.

Pour ceux qui ne connaissent pas ce projet, son but est de fournir des services et des possibilités de visualisation pour des données géographiques (ou non). Le projet contient déjà des sources de données (issues, par exemple, de GeoNames, optd ou encore de l'OpenData). Il est très simple d’ajouter ses propres sources de données pour pouvoir jouer avec.

Parmi les services disponibles :

  • exécuter de simples recherches (trouver cette donnée, trouver toutes les entrées qui ont cette propriété)
  • exécuter des recherches approximatives basées sur une notion de distance entre chaîne de caractères (trouver les données dont le nom ressemble à cela)
  • exécuter des recherches phonétiques (trouver des données qui se prononce comme cela)
  • exécuter des recherches géographiques (trouver les données proches de ce point)
  • afficher les résultats sur une carte, ou bien les exporter en CSV, ou encore utiliser une API Python pour les manipuler directement

Le projet est principalement un package Python, il y a également une interface en ligne de commande assez complète (qui peut s'utiliser un peu comme grep).

Journal De l'exploitation des logs de fail2ban…

Posté par . Licence CC by-sa
31
4
sept.
2017

Comme beaucoup d'entre vous, pour sécuriser l'accès SSH de mon serveur j'utilise fail2ban (en plus des règles habituelles de sécurité). Fail2ban permet d'envoyer un mail à chaque fois qu'il bannit une IP mais finalement personne ne prend le temps d'examiner ces mails car le format n'est pas exploitable.

J'ai donc décidé d'exploiter les logs de fail2ban afin de générer un rapport quotidien.

Pour cela, j'ai utilisé python et les excellentes bibliothèques pandas et matplotlib.

Principe de fonctionnement

1) fail2ban-getlog

Une (...)

Facette, outil de visualisation de séries numériques

Posté par . Édité par Benoît Sibaud. Modéré par Christophe Guilloux. Licence CC by-sa
31
29
juil.
2014
Supervision

Facette est un nouvel outil libre sous licence BSD permettant de réaliser des graphiques à partir de métriques collectées et stockées par divers outils tels que collectd, Graphite, InfluxDB. Cette alternative aux autres logiciels de visualisation permet de présenter sur les mêmes graphiques des séries de données numériques provenant de sources hétérogènes.

logo Facette

Facette est une application web développée en Go, par conséquent très facile à déployer et peu coûteuse en ressources système. L'interface web a été pensée pour permettre une utilisation simple et intuitive, et esthétiquement agréable — ce qui n'est pas toujours le cas des alternatives dans ce domaine ;-) Pour aller plus loin, le logiciel met également à disposition une API RESTful permettant par exemple de se servir de Facette "juste" pour fédérer plusieurs sources de données hétérogènes, ou encore d'automatiser certaines actions au niveau du catalogue interne.

Sortie de GraphStream  1.0

Posté par . Modéré par Nÿco. Licence CC by-sa
30
25
mai
2011
Science

GraphStream, la bibliothèque logicielle en Java de manipulation de graphes dynamiques, est disponible en version 1.0, après plusieurs années de développement.

GraphStream est née de la fusion de diverses parties logicielles développées au fil des ans par les membres de l’équipe RI2C (Réseaux d’Interactions et Intelligence Collective) du LITIS, le Laboratoire d’Informatique du Traitement de l’Information et des Systèmes. Ce projet est né du besoin de manipuler, analyser et visualiser la dynamique des réseaux d’interactions. Le but du projet est de fournir une bibliothèque logicielle répondant à ces besoins, sans fournir le logiciel final.

Sortie du Topology ToolKit (TTK)

Posté par (page perso) . Édité par ZeroHeure, Davy Defaud, palm123, patrick_g et Nils Ratusznik. Modéré par patrick_g. Licence CC by-sa
30
4
avr.
2017
Science

Bonjour à tous,

Nous sommes heureux d’annoncer la sortie du Topology ToolKit (TTK), une bibliothèque libre (licence BSD) pour l’analyse topologique de données en visualisation scientifique.
TTK rend l’analyse topologique de données accessible aux utilisateurs finals grâce à des greffons faciles à utiliser pour la plate‐forme de visualisation ParaView. Grâce à ParaView, TTK prend en charge de nombreux formats de fichiers.

Petit tour des outils de visualisation libres

Posté par (page perso) . Modéré par Nÿco.
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30
10
mai
2010
Audiovisuel
Les outils libres de visualisation d'informations ou de données existent, mais ne sont pas forcément très connus. Je souhaite, via cette dépêche, les mettre en avant et j'espère que les lecteurs de LinuxFr.org sauront les utiliser pour créer de jolies représentations de données pertinentes.

Je me suis donc attaché à présenter dix outils :
  • Graphviz
  • Large Graph Layout
  • Circos
  • IOGraph
  • Code Swarm
  • Gource
  • Gephi
  • Processing
  • Processing.js
  • Nodebox 2

À ce sujet, je vous recommande chaudement la lecture de l'article de LWN.net sur la visualisation des projets et communautés Open Source.

GraphDash, ou comment construire une interface web simple pour vos graphes

Posté par . Édité par Benoît Sibaud et Xavier Claude. Modéré par ZeroHeure. Licence CC by-sa
29
29
juin
2016
Python

GraphDash est un outil développé en Python (avec Flask) et publié sous licence Apache v2.

Il permet de construire une interface web à partir de graphes dont vous disposez. Il vous suffit simplement d'ajouter un fichier contenant des métadonnées. Par exemple:

$ ls default_graph_dir
graph.svg
graph.txt

graph.svg est votre graphe, et graph.txt contient quelques métadonnées au format YAML:

$ cat default_graph_dir/graph.txt
name: graph.svg
family: Category 1
title: '*Real serious* graph'

Vous pouvez bien évidemment placer autant de graphes que vous le souhaitez dans le répertoire, et ensuite lancez GraphDash. Vous obtiendrez une interface web permettant de naviguer, chercher et d'afficher vos graphes.

$ GraphDash -r default_graph_dir
* Running on http://0.0.0.0:5555/ (Press CTRL+C to quit)

Sortie de Tulip 3.4.0

Posté par . Modéré par patrick_g.
28
22
juil.
2010
Science
Tulip est un logiciel d'édition et de visualisation de graphes assez puissant, très stable et surtout capable de gérer des graphes très volumineux. Sa version 3.4.0 apporte de nombreuses nouveautés, des optimisations, mais elle est surtout l'occasion de faire le point sur ce logiciel un peu méconnu. En effet, certains logiciels plus jeunes et parfois moins puissants sont plus en avant de la scène aujourd'hui.

Pour permettre à Tulip d'obtenir l'attention qu'il mérite, voici une description plus détaillée du logiciel.

Narcisse logiciel de visualisation scientifique

Posté par (page perso) . Modéré par patrick_g. Licence CC by-sa
27
13
avr.
2011
Science

Narcisse, le logiciel décrit en 2002 sur LinuxFr, a été remis à la disposition des internautes avec de nouvelles cibles récentes (en particulier les Nokia N810 et N900 sous Linux Maemo) et avec quelques améliorations sur l’IHM et la documentation en ligne.

Il est disponible à l’adresse suivante : http://narcisse.nanocloud.org

Narcisse est un logiciel client/serveur conçu pour transformer des fichiers numériques simples (au format ASCII ou binaire) produits par un tableur, un programme ou écrits à la main dans un éditeur de texte, en dessins complexes 2D ou 3D.

Les fichiers de données et beaucoup d’attributs de visualisation (couleurs, taille, point de vue…) peuvent‐être gérés, soit par une interface fenêtrée, soit par programme (Fortran, C ou C++), soit par script au travers d’un réseau.

De nombreux pilotes sont fournis : Postscript, X11, OpenGL, et même SVG !

Le logiciel est disponible en open source sous licence GPL ; des binaires précompilés sont également disponibles pour des systèmes Unix, principalement Linux.

L’auteur du site est l’auteur du logiciel Narcisse.
Un couplage avec Scilab est aussi proposé.

Matplotlib 1.1 et autres outils de visualisation en Python

Posté par . Modéré par Nÿco. Licence CC by-sa
27
1
nov.
2011
Python

Matplotlib est une bibliothèque en Python très utilisée pour tracer des graphiques en deux et trois dimensions. Le degré de sophistication peut être très élevé mais les choses simples le restent ; pour se donner une idée, il suffit de regarder la galerie d’exemples.
En combinaison avec les bibliothèques scientifiques NumPy ou SciPy et l’interpréteur IPython, nous obtenons un outil de prototypage très pratique.

Matplotlib n’est pas exempte de limitations, pour de grosses séries de données ou des visualisations complexes en trois dimensions. Il faut alors se tourner vers d’autres outils tels que guiqwt ou Mayavi, si l’on veut rester avec des outils en Python.

Sortie de Perfwatcher 2.0

27
8
mar.
2014
Supervision

La nouvelle version majeure de l'outil de métrologie Perfwatcher vient de sortir, Perfwatcher 2.0. Perfwatcher est un frontend pour Collectd (un outil de mesure de performances du système) écrit en PHP, HTML, JavaScript et C.

Présenté sur LinuxFr.org lors de sa sortie en version 1.2, le fonctionnement interne de Perfwatcher a subi un profond remaniement amenant une modularité permettant aujourd'hui son déploiement sur des grilles de calculs de plus de 20000 nœuds.

Pour rappel, Perfwatcher est une interface utilisateur pour Collectd, il permet d'afficher les graphes RRD générés par ce dernier et étend ses fonctionnalités par l'apport de nombreux modules et patchs.

Parmi ceux-ci, le module Top permet l'affichage de la totalité de la liste des processus à la façon de la commande top et ce, à la date et heure de son choix ainsi que l'affichage des processus sous la forme d'une frise chronologique (timeline).

Perfwatcher permet, en outre et ce fut son premier but, d’agréger les données de Collectd par groupes de serveurs afin de, par exemple, visualiser la charge moyenne de parties d'une grille de calcul.

3 bibliothèques javascript à découvrir : D3, Sugar et Batman

27
30
août
2011
JavaScript

D3.js

D3.js est une bibliothèque javascript légère et libre qui permet de manipuler et représenter graphiquement des documents en s'appuyant sur leurs données. Elle est une réécriture de protovis et s'appuie sur des technologies comme HTML5, CSS3 et SVG pour afficher des données et interagir avec elles. Je vous encourage à aller voir les exemples pour voir de quoi est capable d3.js.

Sugar.js

Sugar.js est une bibliothèque qui vise à faciliter la manipulation des objets natifs Javascript et à combler les différences entre navigateurs. Elle ajoute des méthodes bien pratiques aux entiers, chaînes de caractères, fonctions, tableaux, objets, dates... En revanche, elle ne concerne ni les requêtes AJAX ni le DOM (jQuery fait ça très bien).

Batman.js

Batman.js est un petit framework MVC sous licence MIT. Il est écrit en CoffeeScript et peut donc naturellement être utilisé en Javascript afin de structurer une application web qui ferait un fort usage du JS. S'inspirant des principes de Rails (convention over configuration, etc.), il doit permettre de développer rapidement des applications web mono-page.