Forum Linux.debian/ubuntu Problème E: Erreur de lecture - read (21 est un répertoire)

Posté par rastayoupi le 23 août 2010 à 18:00.

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août

2010

Bonjour à tous,
Après avoir fait un aptitude pour un paquet j'ai eu une succession d'erreurs car je n'avais plus d'espace dispo, j'ai agrandi ma partition et voilà les messages que j'obtiens lors de:

apt-get install
apt-get upgrade
aptitude update
....

Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances
Lecture des informations d'état... Erreur !
E: Erreur de lecture - read (21 est un répertoire)
E: Erreur de lecture - read (21 est un répertoire)
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances
Lecture des informations d'état... Erreur !
Lecture de l'information d'état étendu
Initialisation de l'état des paquets... Erreur !
E: Erreur de lecture - read (21 est un répertoire)
E: Erreur de lecture - read (21 est un répertoire)

Merci d'avance pour votre aide. :-)

Pour info:

ls -l /etc/apt/
total 30
drwxr-xr-x 2 root root 4096 aoû 4 11:05 apt.conf.d
-rw------- 1 root root 0 jui 26 09:58 secring.gpg
-rw-r--r-- 1 root root 99 aoû 13 16:26 sources.list
drwxr-xr-x 2 root root 4096 jui 28 14:26 sources.list.d
-rw------- 1 root root 1200 jui 26 09:58 trustdb.gpg
-rw------- 1 root root 7012 jui 28 14:26 trusted.gpg
-rw------- 1 root root 5801 jui 26 09:58 trusted.gpg~

cat /etc/apt/sources.list
deb http://ftp.fr.debian.org/debian/ lenny main
deb http://security.debian.org/ lenny/updates main

ps: je n'ai rien touché dans le dossier /etc/apt/
ps2: je suis sous DEBIAN LIVE (clef usb) mais cela ne change rien :-)

Plus d'infos avec un find / -name 21

/live/cow/var/lib/scrollkeeper/TOC/21
/live/cow/var/lib/scrollkeeper/index/21
/var/lib/scrollkeeper/TOC/21
/var/lib/scrollkeeper/index/21
/proc/irq/21
/proc/3851/task/3851/fd/21
/proc/3851/task/3851/fdinfo/21
/proc/3851/fd/21
/proc/3851/fdinfo/21
/proc/3940/task/3940/fd/21
/proc/3940/task/3940/fdinfo/21
/proc/3940/fd/21
/proc/3940/fdinfo/21
/proc/4005/task/4005/fd/21
/proc/4005/task/4005/fdinfo/21
/proc/4005/fd/21
/proc/4005/fdinfo/21
/proc/4150/task/4150/fd/21
/proc/4150/task/4150/fdinfo/21
/proc/4150/fd/21
/proc/4150/fdinfo/21
/proc/4152/task/4152/fd/21
/proc/4152/task/4152/fdinfo/21
/proc/4152/fd/21
/proc/4152/fdinfo/21
/proc/4153/task/4153/fd/21
/proc/4153/task/4153/fdinfo/21
/proc/4153/task/4212/fd/21
/proc/4153/task/4212/fdinfo/21
/proc/4153/fd/21
/proc/4153/fdinfo/21
/proc/4229/task/4229/fd/21
/proc/4229/task/4229/fdinfo/21
/proc/4229/fd/21
/proc/4229/fdinfo/21
/proc/4231/task/4231/fd/21
/proc/4231/task/4231/fdinfo/21
/proc/4231/fd/21
/proc/4231/fdinfo/21
/proc/4384/task/4384/fd/21
/proc/4384/task/4384/fdinfo/21
/proc/4384/task/4388/fd/21
/proc/4384/task/4388/fdinfo/21
/proc/4384/fd/21
/proc/4384/fdinfo/21

Ensuite un strace :
strace -e trace=file -o /tmp/sortie apt-get update

execve("/usr/bin/apt-get", ["apt-get", "upgrade"], [/* 21 vars */]) = 0
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
access("/etc/ld.so.preload", R_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/etc/ld.so.cache", O_RDONLY) = 3
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/lib/libapt-pkg-libc6.7-6.so.4.6", O_RDONLY) = 3
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/lib/i686/cmov/libutil.so.1", O_RDONLY) = 3
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/lib/libstdc++.so.6", O_RDONLY) = 3
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/lib/i686/cmov/libm.so.6", O_RDONLY) = 3
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/lib/libgcc_s.so.1", O_RDONLY) = 3
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/lib/i686/cmov/libc.so.6", O_RDONLY) = 3
open("/dev/null", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC|O_LARGEFILE, 0666) = 3
open("/usr/lib/locale/locale-archive", O_RDONLY|O_LARGEFILE) = 4
stat64("/var/lib/apt/.", {st_mode=S_IFDIR|0755, st_size=4096, ...}) = 0
stat64("/etc/apt/apt.conf.d/", {st_mode=S_IFDIR|0755, st_size=4096, ...}) = 0
open("/etc/apt/apt.conf.d/", O_RDONLY|O_NONBLOCK|O_LARGEFILE|O_DIRECTORY|O_CLOEXEC) = 4
stat64("/etc/apt/apt.conf.d/01autoremove", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=92, ...}) = 0
stat64("/etc/apt/apt.conf.d/70debconf", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=182, ...}) = 0
open("/etc/apt/apt.conf.d/01autoremove", O_RDONLY|O_LARGEFILE) = 4
open("/etc/apt/apt.conf.d/70debconf", O_RDONLY|O_LARGEFILE) = 4
stat64("/etc/apt/apt.conf", 0xbfffc5c4) = -1 ENOENT (No such file or directory)
stat64("/var/lib/dpkg/status", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=820487, ...}) = 0
stat64("/usr/bin/dpkg", {st_mode=S_IFREG|0755, st_size=365324, ...}) = 0
stat64("/etc/debian_version", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=6, ...}) = 0
open("/var/lib/dpkg/lock", O_RDWR|O_CREAT|O_NOFOLLOW, 0640) = 4
open("/var/lib/dpkg/updates/", O_RDONLY|O_NONBLOCK|O_LARGEFILE|O_DIRECTORY|O_CLOEXEC) = 5
stat64("/etc/apt/sources.list", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=99, ...}) = 0
open("/etc/apt/sources.list", O_RDONLY|O_LARGEFILE) = 5
stat64("/etc/apt/sources.list.d/", {st_mode=S_IFDIR|0755, st_size=4096, ...}) = 0
open("/etc/apt/sources.list.d/", O_RDONLY|O_NONBLOCK|O_LARGEFILE|O_DIRECTORY|O_CLOEXEC) = 5
stat64("/etc/apt/sources.list.d/google-chrome.list", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=169, ...}) = 0
open("/etc/apt/sources.list.d/google-chrome.list", O_RDONLY|O_LARGEFILE) = 5
stat64("/var/lib/apt/lists/ftp.fr.debian.org_debian_dists_lenny_Release.gpg", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=1033, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/security.debian.org_dists_lenny_updates_Release.gpg", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=835, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/dl.google.com_linux_deb_dists_stable_Release.gpg", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=191, ...}) = 0
access("/var/cache/apt/", W_OK) = 0
open("/usr/share/locale/locale.alias", O_RDONLY) = 5
open("/usr/share/locale/fr_FR@euro/LC_MESSAGES/libapt-pkg4.6.mo", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/share/locale/fr@euro/LC_MESSAGES/libapt-pkg4.6.mo", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/share/locale/fr_FR/LC_MESSAGES/libapt-pkg4.6.mo", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/share/locale/fr/LC_MESSAGES/libapt-pkg4.6.mo", O_RDONLY) = 5
open("/usr/lib/gconv/gconv-modules.cache", O_RDONLY) = 5
open("/usr/lib/gconv/ISO8859-15.so", O_RDONLY) = 5
stat64("/var/cache/apt/pkgcache.bin", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=10082838, ...}) = 0
open("/var/cache/apt/pkgcache.bin", O_RDONLY) = 5
stat64("/var/lib/apt/lists/ftp.fr.debian.org_debian_dists_lenny_main_binary-i386_Packages", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=24334812, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/ftp.fr.debian.org_debian_dists_lenny_main_binary-i386_Packages", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=24334812, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/ftp.fr.debian.org_debian_dists_lenny_main_i18n_Translation-fr", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=2695118, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/ftp.fr.debian.org_debian_dists_lenny_main_i18n_Translation-fr", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=2695118, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/ftp.fr.debian.org_debian_dists_lenny_main_i18n_Translation-fr", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=2695118, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/security.debian.org_dists_lenny_updates_main_binary-i386_Packages", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=1972542, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/security.debian.org_dists_lenny_updates_main_binary-i386_Packages", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=1972542, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/security.debian.org_dists_lenny_updates_main_i18n_Translation-fr", 0xbfffc324) = -1 ENOENT (No such file or directory)
stat64("/var/lib/apt/lists/dl.google.com_linux_deb_dists_stable_main_binary-i386_Packages", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=3270, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/dl.google.com_linux_deb_dists_stable_main_binary-i386_Packages", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=3270, ...}) = 0
stat64("/var/lib/apt/lists/dl.google.com_linux_deb_dists_stable_main_i18n_Translation-fr", 0xbfffc324) = -1 ENOENT (No such file or directory)
stat64("/var/lib/dpkg/status", {st_mode=S_IFREG|0644, st_size=820487, ...}) = 0
stat64("/etc/apt/preferences", 0xbfffbc74) = -1 ENOENT (No such file or directory)
stat64("/var/lib/apt/extended_states", {st_mode=S_IFDIR|0755, st_size=8192, ...}) = 0
open("/var/lib/apt/extended_states", O_RDONLY) = 5
open("/usr/share/locale/fr_FR@euro/LC_MESSAGES/libc.mo", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/share/locale/fr@euro/LC_MESSAGES/libc.mo", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/share/locale/fr_FR/LC_MESSAGES/libc.mo", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/usr/share/locale/fr/LC_MESSAGES/libc.mo", O_RDONLY) = 6
open("/usr/lib/gconv/ISO8859-1.so", O_RDONLY) = 6

Bon je n'arrive pas trop à déchiffrer le strace.

J'espère que quelqu'un pourra m'aider parce que je commence à avoir marre des dpkg -i surtout quand il y a des dépendances -_-

Merci d'avance

# melanger les outils c'est pas bon

Posté par NeoX le 23 août 2010 à 18:11. Évalué à 3.

aptitude ou apt mais pas les deux dans une succession de commande

soit
aptitude update aptitude upgrade

soit
apt-get update apt-get upgrade

il me semble que l'un ou l'autre dispose de l'option --fix pour reparer quand y a eu un echec en cours de route
# fichier ou dossier absent

Posté par NeoX le 23 août 2010 à 18:14. Évalué à 2.

d'apres ton strace
access("/etc/ld.so.nohwcap", F_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory) access("/etc/ld.so.preload", R_OK) = -1 ENOENT (No such file or directory)

il semblerait qu'il lui manque deux fichiers
/etc/ld.so.nohwcap
/etc/ld.so.preload
- [^] # Re: fichier ou dossier absent
  
  Posté par rastayoupi le 23 août 2010 à 18:25. Évalué à 1.
  
  Merci pour tes réponses.
  J'ai une machine Debian virtuelle et ces 2 fichiers n'existent pas que ce soit dans /etc ou l'ensemble du système ... :/
  - [^] # Re: fichier ou dossier absent
    
    Posté par NeoX le 23 août 2010 à 19:09. Évalué à 3.
    
    en effet cela ne vient pas de là
    puisque j'ai le meme comportement (avec strace) sur ma machine qui fonctionne
    
    j'ai aussi les NOENT sur ces fichiers
    de meme que sur les locales
    - [^] # Re: fichier ou dossier absent
      
      Posté par ze_lionix (site web personnel) le 23 août 2010 à 20:24. Évalué à 2.
      
      J'abonde, je plusse !
      - si on recherche les deux fichiers dans les paquets debian
      http://www.debian.org/distrib/packages#search_contents
      les fichiers en question ne sont sur aucune version....
      
      C'est simplement le binaire qui commence par les chercher et sinon prend ld du système... Un peu comme un stat sur un fichier de personnalisation et sinon bascule en default ( ex : apt.conf )
      Fuse : j'en Use et Abuse !
# Faire le ménage

Posté par JJD le 23 août 2010 à 19:16. Évalué à 1.

Salut,

S'il y a eu un plantage lors d'une mise à jour précédente en raison du manque d'espace, il peut il y avoir des fichiers corrompus.

Essaie d'effacer tout le contenu de /var/lib/apt/lists/ (si tu as peur, déplace ce contenu ailleurs, mais normalement il n'y a pas de problème). Lors de l'update suivant, comme il n'existera aucun fichier, tout sera téléchargé depuis les dépôts déclarés (et pas seulement les différences).

A+
JJD
- [^] # Re: Faire le ménage
  
  Posté par rastayoupi le 23 août 2010 à 19:27. Évalué à 1.
  
  Merci mais ça n'a rien changé.
  Heureusement que j'ai sauvé avant parce que lors de l'update il me manquait le dossier /var/lib/apt/lists/partial
  Ensuite effectivement tout a été recréé mais toujours cette satané erreur 21 :/
  - [^] # Re: Faire le ménage
    
    Posté par JJD le 23 août 2010 à 19:51. Évalué à 1.
    
    Et bien apparemment, c'est autre chose.
    
    Tes messages d'erreur indiquent :
    Lecture des informations d'état... Erreur !
    
    Essaie donc de supprimer (déplacer, renommer) le fichier /var/lib/dpkg/status et de le remplacer par /var/lib/dpkg/status-old (ce sont des fichiers texte : essaie de regarder leur contenu et la date de modification). Si ça ne donne rien, essaie avec un fichier vide.
    - [^] # Re: Faire le ménage
      
      Posté par ze_lionix (site web personnel) le 23 août 2010 à 20:35. Évalué à 2.
      
      La base status est une bonne piste ( cf mon post rédigé en même temps plus loin ) par contre j'éviterai le fichier vide vu que c'est censé décrire le status des paquets installé sauf erreur de ma part...
      
      status = etat E actuel ( si corrompu ben pas bien ! )
      staus.old = E - 1
      Partir du .old et refaire les niveaux vis à vis de l'état du systeme actuel...
      Prendre le /var/log/dpkg.log et voir ce qui a déjà été upgradé / installe au moment du blocage, et metre à niveau avec un apt-get install --reinstall à mon avis....
      Puis poursuivre la mise a jour du système...
      Fuse : j'en Use et Abuse !
      - [^] # Re: Faire le ménage
        
        Posté par JJD le 23 août 2010 à 22:47. Évalué à 1.
        
        Effectivement, il ne faut pas vider le fichier status, mais récupérer le fichier status-old.
        Au besoin, on peut également trouver des sauvegardes dans /var/backups/dpkg.status.*
- [^] # Re: Faire le ménage
  
  Posté par rastayoupi le 24 août 2010 à 11:03. Évalué à 1.
  
  Merci mais ça n'a rien changé.
  Heureusement que j'ai sauvé avant parce que lors de l'update il me manquait le dossier /var/lib/apt/lists/partial
  Ensuite effectivement tout a été recréé mais toujours cette satané erreur 21 :/
# Statut des paquets / Base corrompue ?

Posté par ze_lionix (site web personnel) le 23 août 2010 à 20:10. Évalué à 4.

Hello,

Vu que tu as un upgrade qui a foiré en cours de route moi je commencerai par me soucier de l'état du système en terme de paquets, d'états......

$>apt-get check
Ca mange pas de pain....

$> dpkg -l | egrep -v '^ii|^rc'
Ca devrait te donner une idée de ce qui est en état incorrecte....

Command qui te sera utilise pour une reinstalle :
$>apt-get install --reinstall [paquet_que_j'ai_explose]

Il se peux si ton disk full était sur /var que tu ai corrompu ta base dpkg des status qui se trouve dans /var/lib/dpkg/ !
J'y chercherais dans le fichiers status ton fameux 21...
Il fait quelle taille par rapport au .old ? quelle diff ?
Fuse : j'en Use et Abuse !
- [^] # Re: Statut des paquets / Base corrompue ?
  
  Posté par rastayoupi le 24 août 2010 à 11:38. Évalué à 1.
  
  Re,
  
  apt-get check renvoie la même erreur 21.
  
  dpkg -l | egrep -v '^ii | ^rc' me renvoie:
  
  Souhait=inconnU/Installé/suppRimé/Purgé/H=à garder
  | État=Non/Installé/fichier-Config/dépaqUeté/échec-conFig/H=semi-installé/W=attend-traitement-déclenchements
  |/ Err?=(aucune)/H=à garder/besoin Réinstallation/X=les deux (État,Err: majuscule=mauvais)
  ||/ Nom Version Description
  +++-====================================-==========================-============================================
  ri bind9-host 1:9.6.ESV.R1+dfsg-0+lenny2 Version of 'host' bundled with BIND 9.X
  rF deskbar-applet 2.22.3.1-1 universal search and navigation bar for GNOM
  rc gnome-nettool 2.22.0-1 network information tool for GNOME
  iU libsvn1 1.5.1dfsg1-4 Shared libraries used by Subversion
  iU skype 2.1.0.81-1 Skype
  iU subversion 1.5.1dfsg1-4 Advanced version control system
  
  Apparemment il fait la même taille que le old.
  J'ai cherché le 21 dans le fichier status, j'ai seulement trouvé
  /usr/share/doc/libdjvulibre21/
  
  J'ai tout mv autre part et cela ne solutionne pas mon problème.
  - [^] # Re: Statut des paquets / Base corrompue ?
    
    Posté par Amand Tihon (site web personnel) le 24 août 2010 à 11:40. Évalué à 1.
    
    21 n'est pas le nom du fichier ou du répertoire, mais le numéro d'erreur (EISDIR).
    - [^] # Re: Statut des paquets / Base corrompue ?
      
      Posté par rastayoupi le 24 août 2010 à 12:43. Évalué à 3.
      
      Problème résolu.
      En fait /var/lib/apt/extended_states était un répertoire, il devrait être un fichier.
      Le fichier existait bien mais sous la forme:
      /var/lib/apt/extended_states.tmp
      
      Ainsi un
      # mv /var/lib/apt/extended_states /var/lib/apt/extended_states.dir
      # mv /var/lib/apt/extended_states.tmp /var/lib/apt/extended_states
      
      M'a permis de résoudre tout ça.
      
      Merci pour votre aide.

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