Mon problème est le suivant : je cherche à faire une page web affichant des résultats du logiciel d'alignement de séquence BLAST.
Mon script (sous apache ou sous un serveur python j'ai testé les 2) execute la commande suivante sur une séquence entrée dans un formulaire et stockée dans un fichier
res = commands.getoutput("/usr/bin/blastall -i "+loc_tmp_fasta+" -p blastp -d
"+db+" -m 8 -o "+loc_tmp_blast)
les variables concaténée, sont les localisation des mes fichier :
loc_tmp_fasta : le fichier de (…)