Puisque tu es en NTFS, tu dois également t'assurer que ta distrib peut les lire. Je ne sais pas comment c'est sous Mandriva, mais sous Fedora, il faut installer des modules tiers. Tu trouveras des infos @ http://www.linux-ntfs.org/ .
Ne compte pas sur le support du NTFS en écriture, j'ai toujours entendu dire que c'était très expérimental et qu'il y avait plein de risque. Une alternative est d'utiliser captive-ntfs @ http://www.jankratochvil.net/project/captive/ . La dernière fois que je m'en suis servi il y avait plein de memory leaks et c'était très lent, mais grosso modo ca marchait en lecture et en écriture.
D'après ce que je vois avec mon Dell x50v, la synchronisation est peut-être au point avec Evolution (pas testé), mais avec Kontact c'est la galère à mettre au point au point que j'ai laissé tombé: le but d'un PDA c'est de gagner du temps, pas d'en perdre.
D'après ce que je vois avec mon Dell x50v, la synchronisation est peut-être au point avec Evolution (pas testé), mais avec Kontact c'est la galère à mettre au point au point que j'ai laissé tombé: le but d'un PDA c'est de gagner du temps, pas d'en perdre.
Pour ce qui est de geeker un peu, tu risques d'être décu par Windows Mobile: j'ai cherché rapidement au début et presque tous les softs qui me tentaient étaient des sharewares limités dans le temps ou en fonctionnalités. Si un linuxfrien pouvait me dire que ca a changé et s'appuyer sur des URL, ca me ferait rudement plaisir.
À propos de Palm, il faut voir. J'ai été adepte à l'époque du Vx, mais je crois avoir vu que PalmOS est sur la fin, et si Palm s'aligne sur du hardware PocketPC, il faut encore que ce dernier ne soit pas proposé trop cher vu la concurrence déjà existante dans ce domaine.
Tout n'est pas noir pour autant: tu peux facilement accéder à ce qu'il y a sur tes cartes mémoires, soit via un lecteur dédié sur port USB, soit via le PDA sur sont craddle. Photo, video, mp3, tout marche très bien. Même l'installation de mon GPS bluetooth était triviale et la navigation marche très bien :)
Je m'interroge sur la facilité de la chose tout de même....
C'est très simple, je t'assure :)
Certe le code génétique final est disponible plus ou moins librement. Mais cela ne permet absolument pas de savoir comment les modifications/évolutions on étés obtenues.
Or, suivant le prossédé utilisé, je suppose que les concequences sur divers parties du génome peuvent varier.
Chaque procédé peut avoir des artefacts, mais les modifications étant faites sur les semences, ces artefacts sont visibles dans le génome : il n'y a pas d'information ailleurs que dans le génome, pas de mémoire biologique en dehors de l'ADN. L'analyse de l'ADN permet donc de savoir l'intégralité des différences qu'il y a entre deux souches différentes, l'une wildtype, l'autre OGM. Ensuite, ces différences ce manifestes différemment suivant le contexte, ce qui peut donner des phénotypes différents. Mais même cette information sur les phénotypes est visible dans l'ADN, pour peu qu'elle soit connue.
S'il était si trivial de trouver des déformations génétiques depuis un echantillon d'ADN, je pense que la génétique serait nettement plus évoluée et omniprésente dans nos vies de tous les jours.
Par exemple:
1. tu séquences
2. tu fais un alignement multiple avec les souches wildtype de la même espèce
3. tu repères les blocks divergents dans les régions codantes (génomique comparative)
4. parmis ceux-ci, tu cherches ceux qui sont particulièrements différents entre les souches wildtype et la souche OGM
5. tu recherches dans les banques de données les annotations concernées
6. tu en déduit les modifications au niveau du transcriptome puis du protéome
7. tu en déduit les modifications au niveau de la fonction.
La dernière étape qui est particulièrement difficile, voire impossible sans nécessiter de couteux tests. C'est le point que tu soulèves et tu as raison de le faire. Ce que je dis, et c'est un domaine que je connais assez bien, c'est que les autres étapes le sont beaucoup moins, et sont même faites en routine dans quasi tous les labos du monde qui font de la biologie moĺeculaire croisée et de la bioinformatique :)
Quant à l'analogie avec l'info et le code source... hum hum.... la biologie est très nettement plus complexe et fourmille d'exception, c'est ce qui rends sa compréhension si interessante :)
En effet, comment savoir si un OGM est néfaste pour l'environnement ou pour notre santé si son « code » est cadenassé par un brevet ?
En plus, le "code" d'un OGM, breveté ou pas, s'obtient facilement avec un séquenceur. L'exploitation commerciale peut peut-être être breveté, mais le code génétique de l'OGM reste nécessaire publiquement accessible, puisque distribué dans chacune des cellules de l'OGM, et il est dès lors relativement trivial d'identifier les modifs qui ont été faites, et de là déduire ce qu'elles impliquent sur le plan métabolique, puis d'imaginer les conséquence sur le plan de la santé publique.
Cet article a décidément été écrit à la va-vite !
La génomique requiert essentiellement de l'argent, et du temps.
Ce n'est pas de la recherche fondamentale, mais ca reste de la R&D car c'est une étape qui prends place dans une démarche industrielle mais vient en amont de la production. Quant à l'argent pour les séquenceurs et le temps humain (qui coute également très cher), il faut bien qu'il vienne de quelque part et qu'il soit possible de l'amortir: il me semble bien qu'une entreprise ne peut pas se permettre d'investir à perte.
Les SAM ne me semble pas du tout aller contre les OGM, mais etre complémentaire de ces derniers. L'ensemble du texte me donne l'impression d'avoir été écrit par quelqu'un qui n'y connait pas grand chose et je ne trouve pas ca rassurant :/
Concernant le coté opensource des marqueurs, je crois qu'il ne faut pas réver: certains sont publics car publiés dans les journaux scientifiques, d'autre ne le sont pas et vu l'impact financier qu'ils peuvent avoir, ils ne le seront pas avant un long moment. Sans vouloir faire l'avocat du diable, la génomique demande de gros efforts de R&D, et lorsque ces efforts sont faits par le secteur privé, il ne me semble pas choquant que ce dernier essaie d'amortir ces couts R&D en cherchant a garder une certaine exclusivité. C'est d'ailleurs pareil pour les médicaments génériques: ils permettent au systeme de santé de couter moins cher, ce qui veut dire également que le retour sur investissement des big pharma est moins stable, donc qu'ils doivent faire des économies ailleurs, et c'est rarement le département marketing qui est touché par ces dernieres. Le secteur de la recherche, par contre...
J'ai eu un problème similaire, résolu par une modification du konsolerc et d'un autre fichier de conf duquel j'ai malheureusement oublié le nom. Essaies en tripatouillant la config et avec des ls -lrt ou des strace pour voir quels sont les fichiers ouverts au démarrage de konsole, et quand ?
Il me semble que ce problème était du au fait que je trimballe mes fichiers de conf depuis très longtemps et que certaines options changent de fichiers de config, sans être retirées des anciens fichiers, lesquels restent prioritaires sur les nouvelles version. Du coup, sauvegarder la config écrit dans le "nouveau fichier de config", qui ne sert à rien.
Sauf erreur, la RHEL AS est certifiée Oracle, et c'est peut-être également le cas pour Suse. Sinon l'un des nombreux clones de la première pourrait faire l'affaire.
J'ai cru comprendre dans ton post que la gratuité est importante ? Si c'est le cas, l'utilisation de postgres ou de mysql pourrait aider. Je ne crois pas qu'il soit très cohérent de faire des économies sur l'O.S. pour utiliser un DBMS payant (et cher, suivant ce que tu veux faire). À moins que tu vises Oracle Database 10g Express Edition (cf. http://www.oracle.com/technology/products/database/xe/index.(...) )?
Les deux sont dépassées, et ne sont pas dans la même gamme: la RHEL AS (actuellement 4) est destinée au marché professionel, et le relais sur le marché personnel a été pris par Fedora (actuellement Core 5). Pour faire simple: RHEL AS 4 pour un serveur, et FC 5 pour un desktop. Tout dépends donc de ton utilisation.
Dans tous les cas, elles sont gratuites, sauf si tu prends un support, bien entendu.
Je confirme: très bonne première impression. Même s'il n'est pas libre ca fait très plaisir de voir cette sortie, d'autant plus que je ne m'y attendais pas du tout !! :)
Sachant que 6.06 est sorti il n'y a pas longtemps, je ne sais pas s'il y a grand intérêt à installer une 5.10 ?
De mon coté j'utilise Kubuntu 6.06 avec grand plaisir. Si tu veux l'essayer "pour voir" tu peux aussi utiliser le liveCD ou le DVD (qui contient un systeme live+de quoi l'installer sur ton disque) :)
Si tu lances sshfs avec l'option "reconnect" et que tu spécifies le nom de ton serveur, la connexion n'est pas restaurée lorsque ce dernier change d'@ip ?
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Ca commence à sentir sévèrement l'offensive...
Dommage que Konqueror, Safari et Opera ne soient supportés tout de même. Savez vous si c'est du à des limitations d'ordre techniques ?
[^] # Re: partitionner puis formatter
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Pb avec des disk dur supplémentaire. Évalué à 1.
Ne compte pas sur le support du NTFS en écriture, j'ai toujours entendu dire que c'était très expérimental et qu'il y avait plein de risque. Une alternative est d'utiliser captive-ntfs @ http://www.jankratochvil.net/project/captive/ . La dernière fois que je m'en suis servi il y avait plein de memory leaks et c'était très lent, mais grosso modo ca marchait en lecture et en écriture.
Good luck !
# partitionner puis formatter
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Pb avec des disk dur supplémentaire. Évalué à 1.
Il ne faudrait pas partitionner puis formatter ton disque par hasard ? Tu dois pouvoir le faire en mode graphique avec qtparted, j'imagine :)
[^] # Re: éléments de réponse...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message cherche PDA. Évalué à 2.
Je reviens sur mes dires, d'après un mail d'aujourd'hui qui va donc bientot être archivé @ http://mail.kde.org/pipermail/kitchensync/2006-July/thread.h(...) la synchro avec Kontact semble marcher sur une gentoo. Je vais essayer dès que j'ai 5 minutes :)
A.
# et Ulteo, au fait ?
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche You OS, un OS en ligne. Évalué à 1.
[^] # Re: pda pour geek
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message cherche PDA. Évalué à 2.
Mazette, je n'y avais jamais pensé !!! Quelques liens:
- emulateur : http://www.pocketinfinity.com/
- jeux: http://www.atari.st/
Que de souvenirs :D
# éléments de réponse...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message cherche PDA. Évalué à 1.
D'après ce que je vois avec mon Dell x50v, la synchronisation est peut-être au point avec Evolution (pas testé), mais avec Kontact c'est la galère à mettre au point au point que j'ai laissé tombé: le but d'un PDA c'est de gagner du temps, pas d'en perdre.
Pour ce qui est de geeker un peu, tu risques d'être décu par Windows Mobile: j'ai cherché rapidement au début et presque tous les softs qui me tentaient étaient des sharewares limités dans le temps ou en fonctionnalités. Si un linuxfrien pouvait me dire que ca a changé et s'appuyer sur des URL, ca me ferait rudement plaisir.
À propos de Palm, il faut voir. J'ai été adepte à l'époque du Vx, mais je crois avoir vu que PalmOS est sur la fin, et si Palm s'aligne sur du hardware PocketPC, il faut encore que ce dernier ne soit pas proposé trop cher vu la concurrence déjà existante dans ce domaine.
Tout n'est pas noir pour autant: tu peux facilement accéder à ce qu'il y a sur tes cartes mémoires, soit via un lecteur dédié sur port USB, soit via le PDA sur sont craddle. Photo, video, mp3, tout marche très bien. Même l'installation de mon GPS bluetooth était triviale et la navigation marche très bien :)
Bonne chance !
[^] # Re: ...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à 1.
[^] # Re: ...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à 3.
[^] # Re: ...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à 3.
[^] # Re: ...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à 4.
C'est très simple, je t'assure :)
Chaque procédé peut avoir des artefacts, mais les modifications étant faites sur les semences, ces artefacts sont visibles dans le génome : il n'y a pas d'information ailleurs que dans le génome, pas de mémoire biologique en dehors de l'ADN. L'analyse de l'ADN permet donc de savoir l'intégralité des différences qu'il y a entre deux souches différentes, l'une wildtype, l'autre OGM. Ensuite, ces différences ce manifestes différemment suivant le contexte, ce qui peut donner des phénotypes différents. Mais même cette information sur les phénotypes est visible dans l'ADN, pour peu qu'elle soit connue.
Par exemple:
1. tu séquences
2. tu fais un alignement multiple avec les souches wildtype de la même espèce
3. tu repères les blocks divergents dans les régions codantes (génomique comparative)
4. parmis ceux-ci, tu cherches ceux qui sont particulièrements différents entre les souches wildtype et la souche OGM
5. tu recherches dans les banques de données les annotations concernées
6. tu en déduit les modifications au niveau du transcriptome puis du protéome
7. tu en déduit les modifications au niveau de la fonction.
La dernière étape qui est particulièrement difficile, voire impossible sans nécessiter de couteux tests. C'est le point que tu soulèves et tu as raison de le faire. Ce que je dis, et c'est un domaine que je connais assez bien, c'est que les autres étapes le sont beaucoup moins, et sont même faites en routine dans quasi tous les labos du monde qui font de la biologie moĺeculaire croisée et de la bioinformatique :)
Quant à l'analogie avec l'info et le code source... hum hum.... la biologie est très nettement plus complexe et fourmille d'exception, c'est ce qui rends sa compréhension si interessante :)
[^] # Re: ...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à 4.
En plus, le "code" d'un OGM, breveté ou pas, s'obtient facilement avec un séquenceur. L'exploitation commerciale peut peut-être être breveté, mais le code génétique de l'OGM reste nécessaire publiquement accessible, puisque distribué dans chacune des cellules de l'OGM, et il est dès lors relativement trivial d'identifier les modifs qui ont été faites, et de là déduire ce qu'elles impliquent sur le plan métabolique, puis d'imaginer les conséquence sur le plan de la santé publique.
Cet article a décidément été écrit à la va-vite !
[^] # Re: La génomique, un gros effort de R&D ? Mouais....
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à 8.
Ce n'est pas de la recherche fondamentale, mais ca reste de la R&D car c'est une étape qui prends place dans une démarche industrielle mais vient en amont de la production. Quant à l'argent pour les séquenceurs et le temps humain (qui coute également très cher), il faut bien qu'il vienne de quelque part et qu'il soit possible de l'amortir: il me semble bien qu'une entreprise ne peut pas se permettre d'investir à perte.
# réaction a chaud...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Génomique Open Source. Évalué à -1.
Concernant le coté opensource des marqueurs, je crois qu'il ne faut pas réver: certains sont publics car publiés dans les journaux scientifiques, d'autre ne le sont pas et vu l'impact financier qu'ils peuvent avoir, ils ne le seront pas avant un long moment. Sans vouloir faire l'avocat du diable, la génomique demande de gros efforts de R&D, et lorsque ces efforts sont faits par le secteur privé, il ne me semble pas choquant que ce dernier essaie d'amortir ces couts R&D en cherchant a garder une certaine exclusivité. C'est d'ailleurs pareil pour les médicaments génériques: ils permettent au systeme de santé de couter moins cher, ce qui veut dire également que le retour sur investissement des big pharma est moins stable, donc qu'ils doivent faire des économies ailleurs, et c'est rarement le département marketing qui est touché par ces dernieres. Le secteur de la recherche, par contre...
wala mes 2 c d'euro...
[^] # Re: menu configurer
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message KDE / Konsole : non-respect des préférences utilisateur. Évalué à 2.
Il me semble que ce problème était du au fait que je trimballe mes fichiers de conf depuis très longtemps et que certaines options changent de fichiers de config, sans être retirées des anciens fichiers, lesquels restent prioritaires sur les nouvelles version. Du coup, sauvegarder la config écrit dans le "nouveau fichier de config", qui ne sert à rien.
Bonne chance en tout cas !
[^] # Re: Embryon de réponse...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Quelle RedHat est mieux est le mieux?. Évalué à 4.
J'ai cru comprendre dans ton post que la gratuité est importante ? Si c'est le cas, l'utilisation de postgres ou de mysql pourrait aider. Je ne crois pas qu'il soit très cohérent de faire des économies sur l'O.S. pour utiliser un DBMS payant (et cher, suivant ce que tu veux faire). À moins que tu vises Oracle Database 10g Express Edition (cf. http://www.oracle.com/technology/products/database/xe/index.(...) )?
# Embryon de réponse...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Quelle RedHat est mieux est le mieux?. Évalué à 2.
Dans tous les cas, elles sont gratuites, sauf si tu prends un support, bien entendu.
# Il doit y avoir plus court, mais un truc dans ce genre....
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Suppression caractères. Évalué à 2.
[^] # Re: Troll
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au journal Google Earth pour Linux. Évalué à 3.
# 6.06
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message [kubuntu 5.10] KDE ?. Évalué à 2.
De mon coté j'utilise Kubuntu 6.06 avec grand plaisir. Si tu veux l'essayer "pour voir" tu peux aussi utiliser le liveCD ou le DVD (qui contient un systeme live+de quoi l'installer sur ton disque) :)
# Camstream
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message cherche un logiciel pour une web came logitech. Évalué à 2.
[^] # Re: option "reconnect" ?
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Probleme avec SSHFS. Évalué à 2.
Si tu arrives à trouver une solution pour ton problème, ca m'interesse aussi :)
# option "reconnect" ?
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message Probleme avec SSHFS. Évalué à 2.
http://www.google.com/search?q=sshfs+reconnect
[^] # Re: en fait ...
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au journal Les mousquetaires, un remake de 3 zéros.... Évalué à 10.
---> []
# Autres navigateurs ?
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Google de plus en plus proche du libre (?). Évalué à 8.
Ca commence à sentir sévèrement l'offensive...
Dommage que Konqueror, Safari et Opera ne soient supportés tout de même. Savez vous si c'est du à des limitations d'ordre techniques ?
[^] # Re: ACPI ? powersaved ?
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message thinkpad T20 qui surchauffe. Évalué à 4.