Recalage d’images, PIV et corrélation d’images — Les bases théoriques

Posté par  . Édité par ZeroHeure, Davy Defaud, Benoît Sibaud, NeoX et palm123. Modéré par ZeroHeure. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
62
4
juil.
2017
Science

Le recalage d’images est utilisé dans la communauté de l’analyse d’images médicales depuis très longtemps (Barnea & Silverman, 1972, Ledbetter et al. 1979), on peut même remonter plus loin dans le temps avec les travaux de Sidney Bertram, 1963 en fournissant tous les outils via des descriptions de circuits analogiques (vraiment impressionnant pour l’époque).
En commençant à travailler sur des images issues d’IRM, j’ai été amené à faire une bibliographie sur les outils utilisés dans l’analyse d’images médicales. J’ai constaté que leurs techniques de recalage d’images étaient très similaires à celles utilisées dans les différents domaines de la mécanique. Après beaucoup de bibliographie, je suis parvenu à situer ce qui est fait en mécanique dans les cadres proposés en analyse d’images médicales.

Cette dépêche est l’occasion pour moi de présenter ces techniques dans le détail.

La prochaine dépêche présentera les logiciels utilisés dans les différentes communautés scientifiques.

Journal Pint of science 2017 : c'est la semaine prochaine !

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
20
10
mai
2017

J'aime boire, j'aime apprendre des choses1, donc je suis fan du festival pint of science qui propose tous les ans depuis 2014 de venir écouter des chercheurs et des doctorants dans des bars en buvant un verre. Les thèmes cette année sont :

  • Les merveilles de l’esprit (neurosciences, psychologie et psychiatrie)
  • Des atomes aux galaxies (chimie, physique et astrophysique)
  • Notre corps (sciences du vivant)
  • Planète Terre (sciences de la terre, évolution et zoologie)
  • Star tech (technologie et ordinateurs)
  • (…)

Journal Ce que j'écoute par curiosité

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
42
2
mai
2017

Passant plusieurs heures par semaine dans des trajets piétons et en transports en commun, j'ai pris l'habitude de télécharger des contenus audio répondant à ma curiosité. Je présente dans ce journal ma sélection personnelle en Français pour ceux qui ont les mêmes envies que moi.

Ayant presque épuisé mon stock (j'écoute plus de contenu par semaine que ce qui est produit par les émetteurs ci-dessous, et j'ai bientôt fini d'écouter leurs archives), j'invite chacun à compléter la liste en commentaires !

(…)

Journal Marche pour les sciences samedi 22 avril 2017

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
17
21
avr.
2017

Initiée au niveau mondial en réponse aux multiples positions anti-sciences du nouveau président des États-Unis, la Marche pour les Sciences (March for Science) aura lieu le 22 avril 2017, Jour de la Terre dans plus de 600 villes à travers le monde. Plus de 20 villes en France organisent un événement à cette occasion, retrouvez-les dans l'agenda du libre. Pour les Parisiens, il y aura à partir de 13 heures un rassemblement avec des animations scientifiques pour les enfants (…)

Journal pydic, une suite d'outil python pour réaliser de la corrélation d'image locale

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
22
14
avr.
2017

Cher journal,
Je t'écris aujourd'hui pour t'annoncer la venue de pydic. pydic, disponible sous licence GPLv3, est une suite d'outil Python permettant de faire de la corrélation d'image locale. Cette suite d'outil, disponible sous la forme d'un unique module pydic.py, s'adresse plus particulièrement aux mécaniciens expérimentateurs qui souhaitent cartographier les déformations au cours d'un essai mécanique comme un essai de flexion, un essai de traction ou que sais-je encore.

Bien qu'en anglais, l'image suivante résume (…)

Sortie du Topology ToolKit (TTK)

Posté par  (site web personnel) . Édité par ZeroHeure, Davy Defaud, palm123, Nils Ratusznik et patrick_g. Modéré par patrick_g. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
30
4
avr.
2017
Science

Bonjour à tous,

Nous sommes heureux d’annoncer la sortie du Topology ToolKit (TTK), une bibliothèque libre (licence BSD) pour l’analyse topologique de données en visualisation scientifique.
TTK rend l’analyse topologique de données accessible aux utilisateurs finals grâce à des greffons faciles à utiliser pour la plate‐forme de visualisation ParaView. Grâce à ParaView, TTK prend en charge de nombreux formats de fichiers.

Journal l'ESA place une grande partie de ses ressources sous licence libre

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
33
22
fév.
2017

Alors que les documents produits par la NASA sont disponibles sous licence libre depuis longtemps, l'ESA gardait ses ressources sous licence propriétaire.
Mais depuis la semaine dernière une grande partie des photos et autres vidéos produites intégralement par l'ESA ou coproduites par l'ESA et pour lesquelles elle a obtenu l'autorisation des autres copropriétaires sont disponibles sous licence CC-BY-SA 3.0 IGO (un licence proche dans l'esprit de la GPL pour ceux qui ne maîtrisent pas la terminologie Creative Commons).

Forum général.hors-sujets Recherche publi scientifique pour mémoire de traduction

Posté par  (site web personnel) . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
2
17
oct.
2016

Bonjour,

D'abord le contexte très simple : J'ai une amie qui a repris ses études de traduction, en faisant un M2 plutôt axé traduction technique.
Elle a voulu trouver pour son corpus de la littérature technique très spécialisée, dans un domaine qu'elle ne connaît vraiment pas (probablement pour tomber sur un maximum de mots nouveaux, je suppose).

Elle cherche donc, pour son corpus de texte pour son mémoire, une publi sur les applications de l'apprentissage machine algorithmique sur la détection (…)

Forum général.général logiciel de détection de plagiat

Posté par  (site web personnel) . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
0
30
sept.
2016

Bonjour,

Connaissez-vous des logiciels libre de détection de plagiat ? Actuellement nous utilisons un logiciel propriétaire et voulons étudier d'autres voies.

Pour l'histoire, je ne suis pas personnellement impliqué dans le groupe plagiat de notre institution, mais relativement proche des personnes qui s'en occupent. Je serais particulièrement heureux de pouvoir leur proposer une solution open-source, qui vas dans le sens de ce qu'on impose aux scientifiques qui font appel à nous ( on ne finance que des articles open-access et on (…)

Open Beauty Facts : que contiennent vraiment nos produits cosmétiques ?

Posté par  . Édité par Xavier Teyssier, bubar🦥, palm123, Benoît Sibaud et NeoX. Modéré par ZeroHeure. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
35
31
juil.
2016
Open Data

Open Beauty Facts est un projet collaboratif en ligne dont le but est de constituer une base de données libre et ouverte sur les produits cosmétiques du monde entier.

Après les aliments, Open Food Facts s’attelle donc à un nouveau chantier : les produits de beauté. Lancé en février 2016, Open Beauty Facts a pour but de réaliser pour les cosmétiques, dentifrices et autres shampooings ce que Open Food Facts a fait pour la nourriture.

Logo Open Beauty Facts

Revue de presse de l'April pour la semaine 22 de l'année 2016

Posté par  (site web personnel, Mastodon) . Modéré par bubar🦥. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
16
6
juin
2016
Internet

La revue de presse de l'April est régulièrement éditée par les membres de l'association. Elle couvre l'actualité de la presse en ligne, liée au logiciel libre. Il s'agit donc d'une sélection d'articles de presse et non de prises de position de l'association de promotion et de défense du logiciel libre.

Sommaire

MathMod 4.0 : nouveaux outils de manipulation des objets mathématiques

Posté par  (site web personnel) . Édité par Davy Defaud, Benoît Sibaud, Nÿco et claudex. Modéré par Pierre Jarillon. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
54
11
fév.
2016
Éducation

MathMod (anciennement K3DSurf) est un logiciel libre (sous licence GPL v3) de modélisation et de manipulation des objets mathématiques décrits par des équations implicites ou paramétriques. MathMod permet de manipuler les objets mathématiques 3D et 4D en les animant d’un mouvement de rotation ou de déformation. Il permet aussi de changer leur propriétés visuelles, calculer leurs intersections en temps réel et exporter le résultat final sous différents formats de fichiers. MathMod est développé avec Qt5/C++, il est disponible pour GNU/Linux, Windows et Mac OS X.

MathModd-4.0

Journal PLRN Article 9 - "Libre" accès aux publications scientifiques de la recherche publique

Posté par  (site web personnel) . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
16
6
oct.
2015

Salut,

Pour info, un autre journal parle déjà du site web consultatif pour le "Projet de Loi pour une République Numérique" sur la forme.

J'aimerais attirer ton attention sur le fond, et pour ce journal sur l'article 9 "Libre accès aux publications scientifiques de la recherche publique".
Je ne sais pas vous, mais je ne vois pas comment cet article peut "favoriser le libre accès aux travaux de recherche publique" (objectif annoncé). Tout ce que je vois, c'est (…)

Prix Ig Nobel de 2015

Posté par  (site web personnel) . Modéré par tuiu pol. Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
42
22
sept.
2015
Science

Les prix Ig Nobel (jeu de mot sur ignoble et Nobel) 2015 ont été attribués le 17 septembre dernier. Rappelons qu’ils récompensent des publications ou des travaux scientifiques qui font des recherches inusuelles et imaginatives. Les vainqueurs ont tous fait des choses qui ont d’abord fait rire, puis réfléchir les gens.

Liste des prix 2015 :

  • chimie : une recette pour partiellement dé-bouillir des œufs ;
  • physique : le test du principe biologique que quasi tous les mammifères vident leur vessie en 21s (à plus ou moins 13s près) ;
  • littérature : le mot « hein ? » (ou son équivalent, huh? en anglais par exemple) existe dans toutes les langues, et on ne sait pas exactement pourquoi ;
  • management : beaucoup de décideurs économiques ont développé dans leur enfance une affinité pour la prise de risque, en étant confronté à des catastrophes naturelles n'ayant pas eu de conséquences personnelles pour eux ;
  • économie : la police de Bangkok (Thaïlande) pour avoir offert plus d'argent aux policiers qui refusent les pot-de-vins ;
  • médecine : les bénéfices ou conséquences biomédicales des baisers intenses (et autres activités interpersonnelles intimes) ;
  • mathématiques : l'utilisation de techniques mathématiques pour déterminer si et comment Moulay Ismaïl ben Chérif, sultan du Maroc de 1697 à 1727, aurait engendré 888 enfants ;
  • biologie : attacher un bâton lesté à l'arrière des poulets (queue artificielle) les fait marcher de la façon dont on pense que les dinosaures marchaient ;
  • diagnostic médical : les appendicites aiguës peuvent être diagnostiquées avec précision via la douleur ressentie par le patient lors du passage sur des dos d'âne ;
  • physiologie et entomologie : la création de l'index Schmidt de pénibilité des piqûres d'hyménoptères, en se faisant piquer à 25 endroits différents du corps pour connaître les endroits les moins et les plus douloureux.

Journal Giulia Anders : "Le charme discret de l'intestin"

Posté par  . Licence CC By‑SA.
Étiquettes :
11
28
août
2015

Cher Nal,

en ce retour de vacances, je te propose de faire l'acquisition d'un livre hautement instructif et par la même divertissant puisque vulgarisé et bien illustré.

Je ne l'ai pas encore terminé mais j'avoue être impressionné par le nombre de découvertes que l'on y fait et surtout qu'on en est qu'au début de la connaissance de notre microbiote.

http://www.actes-sud.fr/catalogue/sciences-humaines-et-sociales-sciences/le-charme-discret-de-lintestin
http://www.slate.fr/story/102351/giulia-enders-intestins

Ce livre va dans le sens où notre système digestif est notre deuxième cerveau, voire notre premier.

En ce (…)