Apport du langage Python dans un service de recherche hospitalière pour mener des analyses de deep learning
Par Clément Benoist − Salle Rosalind Franklin − Dimanche à 11 h 00
Dans les services hospitaliers de recherche cliniques, l'utilisation de python est peu commune, par rapport à d'autres langages de programmation comme R. Mais le développement du machine learning et du deep learning oriente préférentiellement vers le langage python.
Nous montrerons comment le deep learning permet de résoudre des problématiques médicales. Par exemple, dans le cadre de la transplantation d'un rein chez un patient, le médecin surveille le patient et redoute deux événements graves : le décès du patient et le retour en dialyse (=perte du greffon). Lorsque le greffon rénal ne peut plus accomplir sa fonction, une mise sous dialyse est nécessaire ce qui est très lourd pour le patient et cher pour la sécurité sociale. En effet, la dialyse représente plusieurs séances par semaine de plusieurs heures. Des modèles statistiques et de deep learning codés en python que nous avons développés permettent d'anticiper la défaillance du greffon ce qui permettrait au médecin de suivre de manière plus rapprochée les patients si nécessaire et de retarder voire éviter la perte du greffon et le retour en dialyse associé. Les challenges auxquels nous faisons face sont les suivants : 1) Le machine learning et, a fortiori, le deep learning réclament des puissances de calcul considérables, une mutualisation des ressources et une technologie adaptée sont nécessaires. 2) Le deep learning est performant pour les gros volumes de données, ainsi l'accès aux données de la Sécurité sociale permettra d'obtenir des modèles plus performants.
Effectivement, les propos de BG qui visent Amazon éclaboussent un peu ceux qui ont participé, mais c'est la vie et je pense qu'ils s'en remettront et peut-être même qu'elle peut en parler amicalement avec eux. Il y a une vie en dehors de Twitter/FB.
Si elle a menti ou exagéré le montant, c'est limite et peut-être dommage. Pour moi ça change pas grand-chose sur le fond.
En effet, 12 jours par an de congé de formation avec salaire maintenu si la formation est dispensée par un organisme habilité (en général un syndicat). Reste à trouver comment payer la formation. En général, les syndicats la font gratos pour leurs adhérents et peuvent l'offrir aux non-adhérents.
Fille de la montagne, la tête bien faite et les pieds sur terre, Camille Étienne court le monde pour le sauver. À bientôt 25 ans, elle n’a qu’une ambition : convaincre de l’urgence d’agir.
Sur la photo, c'est pas évident.
Ça le devient quand on prend la peine de lire l'article.
Pendant et après la manif, j'ai répété qu'on aurait gagné la même victoire symbolique à bien moindres frais en encerclant la bassine plutôt qu'en essayent d'y entrer par la force. On était assez nombreux.
On m'a rétorqué à juste titre que dès notre approche on s'est fait gazer avant même de pouvoir s'étaler autour. C'est d'ailleurs pour ça qu'on s'est rassemblés au sud ouest pour pas être sous le vent.
C'est pas tout à fait neutre, le fait que les flics à tiré en premier.
En réalité, l'objectif d'entrer dedans était aussi de potentiellement retarder un tout petit peu le chantier, mais c'est mineur (je cite vaguement un organisateur). Et les victoires concrètes (par opposition à la victoire symbolique de la démonstration du nombre) peuvent être obtenues facilement par des sabotages le jour de la manif et même le reste du temps. Les tuyaux sont impossibles à surveiller donc sur le long terme ça sera pas tenable, ça pourra être saboté tout le temps.
Inquiet pour l'avenir moi aussi. Le gvt essaye de toute faire passer par la violence (retraites, grands projets inutiles imposés, etc.). Je ne vois pas de porte de sortie.
«Il y avait huit adultes dans la salle, aucun ne bougeait, témoigne un adolescent présent auprès de nos confrères de la Voix du Nord. Les élèves se levaient pour aller voir ce qu’il avait, on leur criait dessus, on leur disait de se rasseoir, de continuer le bac. Un adulte continuait à passer dans les rangs pour faire signer la feuille de présence, alors que [la victime du malaise] était toujours par terre. Il ne parlait plus, commençait à devenir bleu.»
«Une élève s’est levée quand même et l’a mis en PLS [position latérale de sécurité, ndlr], reprend-il. Nous, on disait qu’il fallait appeler les secours. Ils nous ont laissé 20 minutes avec lui, sans le toucher, sans pouvoir l’aider.» Puis, «la CPE est arrivée en courant, elle a appelé les secours», complète-t-il.
Donc voilà, même en ayant entendu l'enregistrement j’interprète la situation plutôt comme "on ne nous autorise pas encore" que "on nous a interdit". C'est tout de même différent.
Quand il s'agit d'urgence vitale, ça revient un peu au même, non ? En tout cas le raccourci n'est pas outrancier.
Après reste des questions comme "Qui définit ces zones" (je suppose que c'est la Préfecture mais c'est une supposition, on devrait le savoir très vite), et donc "Est-ce que la préfecture aurait pu ouvrir la zone avant ?" Au dire des témoignages sûrement…
Voilà. Malgré l'urgence vitale et le fait que les blessés étaient à l'écart dans un endroit où les secours pouvaient venir, la pref à dit non. C'est bien ce qui lui est reproché (entre autres).
Comme je l'écris plus haut, il y avait pas de raison de penser que le véhicule des secours serait en danger. C'est pas les véhicules de police en train de brûler plus loin qui le menaçaient. C'est pas les manifestants non plus. Et en théorie, ce n'aurait pas du être les grenades non plus puisque les policiers n'étaient pas censé canarder par là (mais bon…).
Tout est dans l'appréciation du risque lié à la position des blessés (qui étaient à l'écart à l'ouest accessibles par une route qui ne traversait pas la zone d'affrontement) vs. urgence vitale.
Ce que disent les manifestants, les élus, la LDH, etc. c'est que l'intervention était possible et que la pref a bloqué inutilement.
La préfète dit que les conditions de sécurité ne permettaient pas d'accueillir les secours (en gros).
C'est une véritable hérésie. Ça criait "médic" dans tous les sens, les secours identifiés SMUR auraient été accueillis à bras ouvert par les manifestants.
A moins que la préfète ait eu peur que les secours se prennent une des quelques milliers de grenades qui ont été balancée par les "forces de l'ordre".
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Par ailleurs, j'ai bien vu le bouton "modifier la police" mais malheureusement ça ne résout pas le problème de fond posé par l'article.
Ça tombe super bien, le texte cité ne dit pas l'inverse, juste que c'est une priorité pour elle, comme pour toi X est une priorité.
Non. Le texte dit qu'ils en ont fait une priorité législative. Donc que M. Macron et sa femme en font une priorité pour le parlement.
French President Emmanuel Macron and his wife, Brigitte, have made internet child safety a legislative priority.
Je dis pas que c'est un scandale anticonstitutionnel. C'est surtout des conneries racontées par des journaux de merde pour romancer un peu l'histoire parce qu'ils aiment bien ça.
Mais ça m'agace. Parce que c'est le plan comm de l'Elysée et qu'on leur sert la soupe (dans les journaux de merde).
A la fin de la PyConFR, le président de l'AFPY (ou plutôt l'ancien président) a remercié Gandi en disant qu'il suffisait de leur faire une demande et ils fournissaient ce dont on avait besoin. Donc au moins de ce point de vue-là, c'est pas du bullshit.
Le cheval blanc d'Henri IV était en réalité gris [1][2]. C'est une légende qui dit que Sully aurait répondu à sa question "blanc", alors que la couleur réelle était grise. On l'appelait aussi parfois "Cheval Blanc" en raison de sa robe crème ou parce que c'était le vin préféré du roi [3].
Les chaussettes de l'archi-duchesse sont elles sèches, archi-sèches ?
Les chaussettes de l'archiduchesse sont sches [1][2], archi-sches, c'est-à-dire qu'elles sont complètement sèches et bien ajustes. Elles ne sont pas humidifiées ou mal ajustes, ce qui est le cas avec les chaussettes sèches normales.
Je dirais, dans son cas, pas de smartphone mais volonté de pas s'exclure des échanges chiffrés mis en place par des groupes, etc.
Dans mon cas ça pourrait être aussi juste parce que l'interface smartphone pour écrire c'est chiant. Je suis devant un PC toute la journée et à l'aise au clavier alors qu'écrire une phrase au tél c'est pour moi un calvaire. D'accord que la connexion au début de la journée avec SMS ou je ne sais quoi c'est pas top, mais ça permet de taper correctement toute la journée.
(Perso, pas de mobile, donc pas de compte Signal du tout. Mais si j'avais un mobile perso, je serais tenté de m'inscrire pour rejoindre des groupes de connaissances et utiliser via interface web.)
Mais je suis d'accord que c'est mieux si on a l'appli (libre) sur son tél au moins pour notification/lecture. Surtout pour des groupes à activité faible, pour pas se connecter pour rien.
Je n'utilise pas mais j'ai un retour d'une utilisatrice qui a un téléphone "non-smart", donc pas l'appli et qui utilise Signal via l'interface web. Lorsqu'elle envoie un SMS à un contact, par défaut, le contact répond avec Signal… et elle ne reçoit pas la réponse jusqu'à ce qu'elle se connecte à un ordi.
Je crois que c'est un réglage de l'appli Signal de son interlocuteur. Mais si c'est comme ça par défaut et ça marche dans 99% des cas (smartphones), c'est compliqué de devoir expliquer à tout ceux qui y comprennent rien qu'il faut changer ce réglage.
(C'est comme ça qu'on se retrouve malgré soi à devoir utiliser un smartphone pour pas être "coupé du monde" ou juste passer pour le relou réfractaire avec qui c'est compliqué. C'est sûr que c'est tellement plus simple d'installer tout et n'importe quoi tant que ça "juste marche".)
Bref, si la fonction SMS est supprimée, ça va peut-être lui résoudre son problème.
J'ai pas la vision sur le logiciel, je connais pas assez, mais peut-être que l'assimilation des deux créait de la confusion.
A vouloir faire trop transparent, on simplifie les choses pour les utilisateurs qui veulent pas comprendre, mais à la fin on habitue les gens à rien comprendre et dès que ça marche plus tout seul c'est la fin du monde. Là, c'est probablement hors-sujet, mais ma modeste expérience des smartphones m'effraie un peu à ce sujet.
[^] # Re: plus rien avoir sur son tel ?
Posté par jihele . En réponse au lien Demande systématique de code PIN en garde à vue. Évalué à 4.
Non, il suffit de n'avoir rien à se reprocher, mon bon monsieur / ma bonne dame.
# Présentation PyConFR 2023
Posté par jihele . En réponse au lien IA et médecine: un nouveau logiciel permet de mieux diagnostiquer les rejets de greffes de reins. Évalué à 4.
Ça me fait penser à cette présentation à la PyCon.
https://www.pycon.fr/2023/fr/talks/1h.html#apport-du-langage-python-dans
# Déjà vu
Posté par jihele . En réponse au lien Le Courrier du hacker (n°223) - Et merde, Git!?!. Évalué à 5.
https://linuxfr.org/users/epeios/liens/et-merde-git
# Suite, réponde d'un humoriste
Posté par jihele . En réponse au lien Blanche Gardin dans « LOL : qui rit, sort » ? L’actrice explique pourquoi ça n’arrivera pas. Évalué à 3.
Trouvé par hasard : https://www.lalibre.be/international/europe/2023/04/25/tas-un-peu-pousse-les-curseurs-ma-cherie-un-humoriste-remet-en-doute-les-propos-de-blanche-gardin-sur-lol-qui-rit-sort-MGTV3V7XFVGO7GZNPPXHLKESEM/
Effectivement, les propos de BG qui visent Amazon éclaboussent un peu ceux qui ont participé, mais c'est la vie et je pense qu'ils s'en remettront et peut-être même qu'elle peut en parler amicalement avec eux. Il y a une vie en dehors de Twitter/FB.
Si elle a menti ou exagéré le montant, c'est limite et peut-être dommage. Pour moi ça change pas grand-chose sur le fond.
[^] # Re: Amélioration
Posté par jihele . En réponse au lien Machines à laver, smartphones : l’État veut nous pousser à réparer. Évalué à 6.
On est bien d'accord. J'allais mettre un lien vers ce journal et je réalise que c'est le tien.
# engreve.info
Posté par jihele . En réponse au lien Le syndicat Solidaires Informatique lance un appel à la grève jusqu’au 31 décembre 2027. Évalué à 4.
On va donc devoir attendre 2028 pour voir le gif changer sur https://engreve.info/.
[^] # Re: Et ne pas oublier aussi
Posté par jihele . En réponse au lien Le syndicat Solidaires Informatique lance un appel à la grève jusqu’au 31 décembre 2027. Évalué à 5.
En effet, 12 jours par an de congé de formation avec salaire maintenu si la formation est dispensée par un organisme habilité (en général un syndicat). Reste à trouver comment payer la formation. En général, les syndicats la font gratos pour leurs adhérents et peuvent l'offrir aux non-adhérents.
Catalogue de formations du CEFi (Solidaires) : https://solidaires.org/se-former/catalogue-des-formations/
# Les pieds sur terre
Posté par jihele . En réponse au lien Camille Étienne, activiste pour le climat : “L’écoanxiété est une réponse saine à un monde malade”. Évalué à 2.
Sur la photo, c'est pas évident.
Ça le devient quand on prend la peine de lire l'article.
[^] # Re: ctrl-c, ctrl-v
Posté par jihele . En réponse au lien Pétition pour la dissolution de la BRAV-M - Episode 2. Évalué à 1.
Je me suis fait la même réflexion.
Quitte à en refaire une, j'aurais enlevé les termes qui ont servi de prétexte pour ignorer celle d'avant.
Il y avait même moyen de prendre le contrepied et d'utiliser flatterie/ironie/sarcasme pour obtenir le même résultat sans prêter le flanc.
Mais bon, c'est pas moi qui l'ai fait.
# Liens précédents
Posté par jihele . En réponse au lien Pétition pour la dissolution de la BRAV-M - Episode 2. Évalué à 3.
# Quand j'entends le mot [violences policières], personnellement, je m'étouffe
Posté par jihele . En réponse au lien Fin de non-recevoir de la pétition demandant la dissolution de la BRAV-M. Évalué à 10.
https://www.politis.fr/articles/2023/04/coups-insultes-brimades-les-victimes-temoignent/
[^] # Re: C'est un poil plus compliqué que ça...
Posté par jihele . En réponse au lien Sainte-Soline : un opérateur du Samu dit avoir reçu "l'ordre de ne pas envoyer" de secours. Évalué à 3.
C'est terrible la limite de temps d'édition des commentaires. Daisolay pour les photes qui piques au-dessus.
[^] # Re: C'est un poil plus compliqué que ça...
Posté par jihele . En réponse au lien Sainte-Soline : un opérateur du Samu dit avoir reçu "l'ordre de ne pas envoyer" de secours. Évalué à 7.
Pendant et après la manif, j'ai répété qu'on aurait gagné la même victoire symbolique à bien moindres frais en encerclant la bassine plutôt qu'en essayent d'y entrer par la force. On était assez nombreux.
On m'a rétorqué à juste titre que dès notre approche on s'est fait gazer avant même de pouvoir s'étaler autour. C'est d'ailleurs pour ça qu'on s'est rassemblés au sud ouest pour pas être sous le vent.
C'est pas tout à fait neutre, le fait que les flics à tiré en premier.
En réalité, l'objectif d'entrer dedans était aussi de potentiellement retarder un tout petit peu le chantier, mais c'est mineur (je cite vaguement un organisateur). Et les victoires concrètes (par opposition à la victoire symbolique de la démonstration du nombre) peuvent être obtenues facilement par des sabotages le jour de la manif et même le reste du temps. Les tuyaux sont impossibles à surveiller donc sur le long terme ça sera pas tenable, ça pourra être saboté tout le temps.
Inquiet pour l'avenir moi aussi. Le gvt essaye de toute faire passer par la violence (retraites, grands projets inutiles imposés, etc.). Je ne vois pas de porte de sortie.
[^] # Re: Triste parallèle
Posté par jihele . En réponse au lien Sainte-Soline : un opérateur du Samu dit avoir reçu "l'ordre de ne pas envoyer" de secours. Évalué à 10.
Le témoignage est incroyable:
[^] # Re: Mensonges préfectoraux (évidemment)
Posté par jihele . En réponse au lien Sainte-Soline : un opérateur du Samu dit avoir reçu "l'ordre de ne pas envoyer" de secours. Évalué à 6.
Article de Politis spécifiquement axé sur les mensonges gouvernementaux : https://www.politis.fr/articles/2023/03/repression-a-sainte-soline-les-trois-mensonges-de-letat/
Sélection plus large d'articles de la presse indé : https://portail.basta.media/apres-sainte-soline
[^] # Re: C'est un poil plus compliqué que ça...
Posté par jihele . En réponse au lien Sainte-Soline : un opérateur du Samu dit avoir reçu "l'ordre de ne pas envoyer" de secours. Évalué à 10.
Quand il s'agit d'urgence vitale, ça revient un peu au même, non ? En tout cas le raccourci n'est pas outrancier.
Voilà. Malgré l'urgence vitale et le fait que les blessés étaient à l'écart dans un endroit où les secours pouvaient venir, la pref à dit non. C'est bien ce qui lui est reproché (entre autres).
Comme je l'écris plus haut, il y avait pas de raison de penser que le véhicule des secours serait en danger. C'est pas les véhicules de police en train de brûler plus loin qui le menaçaient. C'est pas les manifestants non plus. Et en théorie, ce n'aurait pas du être les grenades non plus puisque les policiers n'étaient pas censé canarder par là (mais bon…).
Tout est dans l'appréciation du risque lié à la position des blessés (qui étaient à l'écart à l'ouest accessibles par une route qui ne traversait pas la zone d'affrontement) vs. urgence vitale.
Ce que disent les manifestants, les élus, la LDH, etc. c'est que l'intervention était possible et que la pref a bloqué inutilement.
# Mensonges préfectoraux (évidemment)
Posté par jihele . En réponse au lien Sainte-Soline : un opérateur du Samu dit avoir reçu "l'ordre de ne pas envoyer" de secours. Évalué à 10.
La préfète dit que les conditions de sécurité ne permettaient pas d'accueillir les secours (en gros).
C'est une véritable hérésie. Ça criait "médic" dans tous les sens, les secours identifiés SMUR auraient été accueillis à bras ouvert par les manifestants.
A moins que la préfète ait eu peur que les secours se prennent une des quelques milliers de grenades qui ont été balancée par les "forces de l'ordre".
Autres articles sur le sujet :
et encore plein d'autres dans la presse indépendante.
[^] # Re: Médiapart
Posté par jihele . En réponse au lien Ils s'alarment des violences illégales de la police en France et disent au pouvoir d'arrêter ça. Évalué à 4.
Quand j'active le mode lecture, j'ai ça :
Par ailleurs, j'ai bien vu le bouton "modifier la police" mais malheureusement ça ne résout pas le problème de fond posé par l'article.
[^] # Re: 1ère dame de France et démocratie
Posté par jihele . En réponse au lien Empêcher les parents de publier trop de photos de leurs enfants sur les réseaux sociaux. Évalué à 6.
Non. Le texte dit qu'ils en ont fait une priorité législative. Donc que M. Macron et sa femme en font une priorité pour le parlement.
Je dis pas que c'est un scandale anticonstitutionnel. C'est surtout des conneries racontées par des journaux de merde pour romancer un peu l'histoire parce qu'ils aiment bien ça.
Mais ça m'agace. Parce que c'est le plan comm de l'Elysée et qu'on leur sert la soupe (dans les journaux de merde).
# 1ère dame de France et démocratie
Posté par jihele . En réponse au lien Empêcher les parents de publier trop de photos de leurs enfants sur les réseaux sociaux. Évalué à 8.
Heu… quelqu'un a voté pour elle ? Ou bien il l'a nommée à un poste important ?
[^] # Re: Panique un peu vite?
Posté par jihele . En réponse au journal RIP Gandi.net. Évalué à 6.
A la fin de la PyConFR, le président de l'AFPY (ou plutôt l'ancien président) a remercié Gandi en disant qu'il suffisait de leur faire une demande et ils fournissaient ce dont on avait besoin. Donc au moins de ce point de vue-là, c'est pas du bullshit.
# J'ai appris des choses
Posté par jihele . En réponse au lien Un concurrent de ChatGPT gratuit et sans inscription. Évalué à 4.
Quelle est la couleur du cheval blanc d'henry IV
Les chaussettes de l'archi-duchesse sont elles sèches, archi-sèches ?
# Git
Posté par jihele . En réponse au message je cherche à contacter Jehan - dev Gimp. Évalué à 4.
J'arrive après la bataille mais il y a aussi l'adresse avec laquelle il signe ses commits.
[^] # Re: Confusion SMS - Signal
Posté par jihele . En réponse au journal Suppression de la gestion des SMS par Signal. Évalué à 3.
Je dirais, dans son cas, pas de smartphone mais volonté de pas s'exclure des échanges chiffrés mis en place par des groupes, etc.
Dans mon cas ça pourrait être aussi juste parce que l'interface smartphone pour écrire c'est chiant. Je suis devant un PC toute la journée et à l'aise au clavier alors qu'écrire une phrase au tél c'est pour moi un calvaire. D'accord que la connexion au début de la journée avec SMS ou je ne sais quoi c'est pas top, mais ça permet de taper correctement toute la journée.
(Perso, pas de mobile, donc pas de compte Signal du tout. Mais si j'avais un mobile perso, je serais tenté de m'inscrire pour rejoindre des groupes de connaissances et utiliser via interface web.)
Mais je suis d'accord que c'est mieux si on a l'appli (libre) sur son tél au moins pour notification/lecture. Surtout pour des groupes à activité faible, pour pas se connecter pour rien.
# Confusion SMS - Signal
Posté par jihele . En réponse au journal Suppression de la gestion des SMS par Signal. Évalué à 6.
Je n'utilise pas mais j'ai un retour d'une utilisatrice qui a un téléphone "non-smart", donc pas l'appli et qui utilise Signal via l'interface web. Lorsqu'elle envoie un SMS à un contact, par défaut, le contact répond avec Signal… et elle ne reçoit pas la réponse jusqu'à ce qu'elle se connecte à un ordi.
Je crois que c'est un réglage de l'appli Signal de son interlocuteur. Mais si c'est comme ça par défaut et ça marche dans 99% des cas (smartphones), c'est compliqué de devoir expliquer à tout ceux qui y comprennent rien qu'il faut changer ce réglage.
(C'est comme ça qu'on se retrouve malgré soi à devoir utiliser un smartphone pour pas être "coupé du monde" ou juste passer pour le relou réfractaire avec qui c'est compliqué. C'est sûr que c'est tellement plus simple d'installer tout et n'importe quoi tant que ça "juste marche".)
Bref, si la fonction SMS est supprimée, ça va peut-être lui résoudre son problème.
J'ai pas la vision sur le logiciel, je connais pas assez, mais peut-être que l'assimilation des deux créait de la confusion.
A vouloir faire trop transparent, on simplifie les choses pour les utilisateurs qui veulent pas comprendre, mais à la fin on habitue les gens à rien comprendre et dès que ça marche plus tout seul c'est la fin du monde. Là, c'est probablement hors-sujet, mais ma modeste expérience des smartphones m'effraie un peu à ce sujet.